動(dòng)衛(wèi)所聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)等單位在豬德爾塔冠狀病毒遺傳演化方面取得新進(jìn)展
時(shí)間:2022-04-01 17:48
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? ????豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV),又名豬丁型冠狀病毒,是具有包膜的單股正鏈RNA病毒,與新冠肺炎病毒(SARS-CoV-2)同屬于冠狀病毒科,是已知RNA病毒中基因組最大的一類病毒。PDCoV于2012年首次在香港豬群中被發(fā)現(xiàn)。2014年在美國(guó)各大豬場(chǎng)暴發(fā)該病,并隨后流行于世界各地,包括我國(guó)(圖1)。之后,多篇?jiǎng)游镌囼?yàn)研究證實(shí)PDCoV可感染雞、火雞、犢牛等,并表現(xiàn)出輕度腹瀉癥狀。2021年,Nature雜志還發(fā)表了PDCoV感染海地兒童的論文。在新冠肺炎大流行期間,人類高度關(guān)注包括PDCoV在內(nèi)的動(dòng)物冠狀病毒跨物種傳播。





? ????論文網(wǎng)址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503

圖1 PDCoV在世界的流行分布
? ????近日,題為“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究論文在獸醫(yī)權(quán)威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》(Top一區(qū)期刊)在線發(fā)表。遺傳進(jìn)化分析表明本研究分離的和已知的所有PDCoV毒株可分為中國(guó)譜系、美國(guó)譜系和東南亞等三大譜系(圖2);重建的PDCoV全球空間擴(kuò)散網(wǎng)絡(luò)研究顯示PDCoV起源于1996年左右的亞洲,2007年左右傳播到美國(guó),然后蔓延到東亞和南美洲,海地人感染的PDCoV最有可能源自美國(guó)(圖3、圖4)。
圖2 PDCoV遺傳進(jìn)化分析

圖3 PDCoV全基因組的歷史演化分析

圖4 PDCoV 空間擴(kuò)散

圖 5論文在線截圖
? ????華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院2021級(jí)博士研究生李根、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物衛(wèi)生研究所翟少倫研究員、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院已畢業(yè)博士研究生/我院擬進(jìn)站博士后周霞博士為論文共同第一作者,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院賀東生教授和陳瑞愛教授為共同通訊作者。該論文獲得了廣東省生豬產(chǎn)業(yè)體系創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、廣東省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、廣東省嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技實(shí)驗(yàn)室肇慶分中心重點(diǎn)項(xiàng)目、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院人才培養(yǎng)項(xiàng)目等的資助。? ????論文網(wǎng)址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503