動衛(wèi)所在廣東省人工馴養(yǎng)竹鼠攜帶圓環(huán)病毒遺傳多樣性與跨種傳播研究方面取得新進展
近日，動衛(wèi)所在農林科學期刊Transboundary and Emerging Diseases（獸醫(yī)學一區(qū)，IF=4.3）發(fā)表了題為“The Genetic Diversity and Interspecific Transmission of Circovirus in Rhizomys sinensisin Guangdong, Southern China”的研究性論文。研究團隊在前期揭示了人工繁育竹鼠可攜帶多種嚙齒類冠狀病毒以及存在犬冠狀病毒的跨種間傳播（X.H. Wang. et al. Virus Evol. 2022）之后，該文進一步揭示了其攜帶重組體圓環(huán)病毒的遺傳多樣性與跨種傳播事件，拓展了對竹鼠中圓環(huán)病毒的遺傳多樣性與跨種傳播的認識。動衛(wèi)所與華南農業(yè)大學聯合培養(yǎng)的博士研究生任照文，袁子國教授、羅勝軍副研究員為論文共同第一作者，王曉虎研究員和廖明教授為論文共同通訊作者。
嚙齒動物（嚙齒目，Rodentia）是全球分布最廣泛，種類最多的哺乳動物，有33科2277種（約占所有哺乳動物物種的43%）。竹鼠作為嚙齒動物的一種，主要分布于中國南方，以竹子、芒草和植物莖稈等為食。該研究團隊利用病毒宏轉錄組測序、全基因組測序和生物信息學分析等方法展示了廣東省人工馴養(yǎng)竹鼠體內的病毒組結構特征。研究結果顯示，廣東省竹鼠種群攜帶的病毒reads覆蓋了22個病毒科，包含了大量的DNA病毒，其中圓環(huán)病毒科成員占據主導地位，其reads總數超過總病毒reads的75%。利用全基因組測序和生物信息學分析發(fā)現，廣東省的竹鼠體內攜帶了3種圓環(huán)病毒，其中竹鼠圓環(huán)病毒（Bamboo rat circovirus）流行率最高，達64.1%（125/195）。目前，竹鼠圓環(huán)病毒分為3個進化支，不同的進化支在特定位點存在核苷酸替換規(guī)律，這很可能是該病毒進化分群的關鍵。同時，研究團隊首次從竹鼠種群中分離到豬圓環(huán)病毒2（PCV2），屬于PCV2d。這一發(fā)現將有助于進一步理解PCV2的宿主范圍、遺傳進化和流行病學，也為PCV2可通過嚙齒動物傳播提供直接數據。此外，文章還監(jiān)測到竹鼠體內可能存在一種新的圓環(huán)病毒，且種群的流行率較高（44.1%），與駱駝、蝙蝠和鯨魚來源的圓環(huán)病毒具有較近的親緣關系。
本研究得到了廣東省林業(yè)局自然資源事務（生態(tài)林業(yè)建設）專項資金項目、廣東省科技規(guī)劃基金（2021B1212050021）、廣東省農業(yè)科學研究院協(xié)同創(chuàng)新中心項目（XTXM202202）、廣州市科技計劃項目（2023E04J1256）等資助。
原文鏈接：https://doi.org/10.1155/2023/6668569
