我所在長豇豆基因組研究方面取得新進展
近日，我所在植物科學著名期刊Plant Biotechnology Journal（中科院大類一區(qū)，IF = 13.8）上發(fā)表題為“A near-complete assembly of asparagus bean provides insights into anthocyanin accumulation in pods”的研究論文，完成了長豇豆接近完整的基因組組裝，并率先克隆了豇豆莢花青素合成的關鍵基因。我所葉菜豆類資源與育種團隊楊易博士和中山大學吳志坤博士為論文的共同第一作者，我所張艷副研究員為該論文的通訊作者。浙江省農(nóng)業(yè)科學院李國景研究員，吳新義副研究員參與了該項工作。我所為第一署名單位，中山大學和浙江省農(nóng)科院為共同合作單位。
長豇豆(Vigna unguiculatassp. sesquipedialis)是一種重要豆類蔬菜，被譽為亞洲十大栽培蔬菜之一，中國是世界上長豇豆最大的種植和消費國。目前現(xiàn)有長豇豆基因組仍存在一定數(shù)量的間隙和未定位序列，這給功能基因組學研究帶來挑戰(zhàn)。作為果菜類蔬菜，外觀和營養(yǎng)是重要的品質(zhì)性狀，花青素賦予植物絢麗色彩的同時亦有保健功效，然而，調(diào)控豇豆莢花青素積累的關鍵基因仍然未知。
本研究綜合利用多種平臺的測序數(shù)據(jù)，組裝完成了長豇豆豐產(chǎn)6號接近完整的基因組，解鎖了豇豆基因組中結(jié)構(gòu)最為復雜的著絲粒區(qū)域、端粒區(qū)域及大片段重復序列等，這是目前最完整的豇豆基因組。同時綜合利用該基因組和大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，成功鑒定出一個控制長豇豆豆莢色澤的關鍵轉(zhuǎn)錄因子基因VuMYB114，并進行功能驗證。相關發(fā)現(xiàn)為闡明長豇豆花青素代謝途徑的精細調(diào)控機制，以及未來設計育種提高豆莢的外觀及營養(yǎng)價值奠定了基礎。該成果是豇豆基因組學研究的重大突破，為豇豆研究領域提供了新的有力工具和重要理論基礎。
該研究得到了廣東省自然科學基金、廣東省重點領域研發(fā)計劃項目和廣東省農(nóng)業(yè)科學院創(chuàng)新基金等項目的資助。
原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/pbi.14142
