劉琦
研究員，水稻生物信息與大數(shù)據(jù)育種研究室主任，博士畢業(yè)于中國林業(yè)科學(xué)研究院林木遺傳育種專業(yè)，隨后在哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院從事博士后研究工作，主要研究領(lǐng)域是生物信息學(xué)、比較基因組學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)，進(jìn)一步應(yīng)用于水稻育種研究。
已發(fā)表SCI論文36篇，其中作為一作（含共一和通訊）在Molecular Cell、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、EMBO reports、Bioinformatics、PLoS Computational Biology、Human mutation和Genomics等期刊上發(fā)表多篇高水平論文，作為主要生物信息學(xué)作者在Nature、Nature Protocols、Nature Communications、Cell Research等上發(fā)表基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控研究相關(guān)論文。
主持和參與多項課題，兩次獲得中國林學(xué)會“青年優(yōu)秀論文獎”。建立了多種生物信息學(xué)算法、軟件和數(shù)據(jù)庫，為基因調(diào)控研究提供重要的生物信息學(xué)支持。同時，基于RNA調(diào)控組學(xué)開展了RNA表觀修飾特別是tRNA修飾的生物學(xué)機(jī)制研究，開發(fā)TRAC-Seq計算方法首次實現(xiàn)單堿基分辨率的 m7G tRNA 修飾譜繪制，揭示了m7G修飾能影響特定基因的翻譯進(jìn)而調(diào)節(jié)細(xì)胞分化，為開發(fā)tRNA水平的分子標(biāo)記提供了新思路。目前開展的研究主要為運(yùn)用上述軟件并開發(fā)新的生物信息學(xué)軟件和技術(shù)在個體和群體水平研究水稻生長發(fā)育、雜種優(yōu)勢、抗逆的系統(tǒng)調(diào)控機(jī)制，挖掘水稻優(yōu)勢性狀的分子標(biāo)記，為基于大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)育種提供重要理論基礎(chǔ)和生物信息學(xué)支持。
